Cienciano es el único equipo peruano que se sostiene en competencias internacionales. Consiguió el segundo puesto del Grupo B de la CONMEBOL Sudamericana en su sexta participación, eliminó a Lanús en los playoffs y ahora busca la hazaña del 2003.
La primera vez que participó fue el 2003 y fue allí cuando se consagró campeón. La segunda fue en 2004, invitado como campeón defensor y se terminó yendo en octavos de final ante Liga de Quito.
La tercera llegó en el 2009, cuando Liverpool de Uruguay lo dejó sin chances en la primera fase. Luego no pudo clasificar por muchos años a este torneo hasta que llegó el 2023, cuando Universitario lo dejó sin opciones en la fase preliminar.
La penúltima vez fue en el 2025, llegando hasta octavos de final y siendo eliminado por Bolivar. En fase de grupos le quitó el primer puesto a Atlético Mineiro.
Este 2026 ha logrado meterse a repechaje y limpió a Lanús con una remontada que pasó a la historia grande del fútbol peruano. Ahora está en octavos de final, instancia en la que se medirá ante Botafogo. Eso sí, busca siempre repetir el plato del 2003, temporada en la que salió campeón de la CONMEBOL Sudamericana.