Aunque la pasó complicado en los últimos años, Universitario ha vuelto a ser importante a nivel internacional y esta vez con una clasificación a octavos de final de la CONMEBOL Libertadores, algo que no conseguían hace 15 años. En algún momento fue subcampeón y también fue capaz de vencer a rivales importantes en el camino.
2010, la última vez en octavos
En la temporada 2010 Universitario logró meterse a octavos siendo segundo del grupo con 10 puntos. Allí se encontró con São Paulo y pudo llevar el partido hasta los penales, donde terminó eliminado. Una participación más que digna y que inició con la atajada de Llontop sobre Ceni en el primer penal, pero luego el cuadro tricolor lo dio vuelta.
Subcampeón en 1972
La mejor participación de Universitario se dio hace más de 50 años. Terminó como líder de su grupo con 8 puntos por encima de U. De Chile, Alianza Lima y Unión San Felipe. Luego, en el Grupo del triangular que se jugaba en esos años, terminó primero solo por diferencia de goles. Hizo 4 puntos, igual que Peñarol.
En la final se encontró con Independiente de Argentina, uno de los bravos de Sudamérica en esos años y terminó empatando sin goles en el ida y cayendo 2-1 en la vuelta. Nunca estuvo más cerca.
1967, la otra gran campaña
En su cuarta participación en la Copa Libertadores, Universitario fue emparejado con Cruzeiro (Brasil), Sport Boys, Deportivo Galicia y Deportivo Italia (Venezuela) en el Grupo 1, y avanzó a las semifinales al acabar segundo con 11 puntos, 4 por debajo del club de Belo Horizonte.
Las semifinales se jugaban con dos grupos de cuatro equipos cada uno, cuyo ganador clasificaba a la final. La ‘U’, que fue emparejado con Racing Club, River Plate y Colo Colo, acabó igualado en puntos (9) con la ‘Academia’, por lo que se jugó un partido de desempate y el equipo de Tomás Iwasaki no pudo con su rival y cayó 2-1 en Santiago de Chile.
Aquella campaña será recordada por el inolvidable doble triunfo que logró Universitario en Buenos Aires en apenas 48 horas: venció 1-0 a River Plate y 2-1 a Racing Club.